核酸蛋白互作(RNA/DNA pull down、CHIRP-MS)服务
(DH1008)
一、服务介绍
核酸蛋白互作(RNA/DNA pull down、CHIRP-MS)用于目的RNA或DNA的互作蛋白验证或筛选,这三种技术是捕获RNA/DNA-蛋白复合体的*常用方法,结合western-blot实验可以验证某种蛋白是否与目的RNA/DNA互作,结合质谱技术可以高通量鉴定与RNA/DNA结合的目的蛋白。
RNA/DNA pull down是研究体外条件下RNA或DNA与蛋白互作的重要技术。该技术通过体外转录目的RNA的一部分或全长,用生物素标记转录产物,再与链霉亲和素磁珠孵育使之固定在磁珠上,用以“pull down”互作蛋白,纯化的产物蛋白经特定抗体的western-blot实验,可验证某种蛋白与目的RNA/DNA是否有相互作用;纯化的蛋白经质谱鉴定,即可筛选到与目的RNA结合的蛋白。
CHIRP-MS是研究体内条件下RNA与蛋白互作的技术。该技术在特定时间点用甲醛交联等方式固定细胞内RNA与蛋白及核酸的互作复合物,再利用生物素标记的探针及链霉亲和素磁珠纯化出与RNA结合的蛋白及核酸的复合物,分离产物中的蛋白质做质谱鉴定,即可筛选出与目的RNA结合的蛋白。
二、服务内容及价格
服务编号 |
服务内容 |
服务价格 |
服务周期(工作日) |
DH1008-1 |
RNA pull down服务 |
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DH1008-2 |
DNA pull down服务 |
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DH1008-3 |
CHIRP-MS服务 |
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咨询 |
三、客户提供
1、目的基因、目的蛋白信息。(包括物种、序列或者ID,保密文件除外)
2、细胞株及培养信息
3、待测蛋白信息及检测所用蛋白抗体
4、相关文献(可选)。
四、服务流程
1)载体构建GST-靶蛋白融合表达载体
2)GST-靶蛋白表达
3)WB检测蛋白融合情况
4) 细胞裂解,获取总蛋白裂解液
5) GST-pull down调取互作结合蛋白
6) 蛋白纯化
7) 数据分析及Result Figure处理
五、提交给客户结果
1、原始数据、结果图片(包括Input、阳性及阴性对照结果);
2、标准实验报告(包括详细的材料与方法);
3、SCI标准Result Figure。
六、服务项目说明
1.实验周期:具体需要根据实验情况而定。
2.对实验有特殊要求,请另询价。
3.双方签订合同后,收取50%首付后启动实验。