WB实验干货-实验介绍、蛋白提取、蛋白定量
一、WB实验介绍
WB(Western Blot,蛋白免疫印迹)是一种常规的蛋白分析技术,常用于鉴定某种蛋白,并能对蛋白进行定性和半定量分析。
WB实验的基本核心理念是抗原抗体的特异性反应,通过变性胶 SDS-PAGE 将不同分子量的蛋白质分离开,然后转移到固相载体 PVDF 膜上,再用脱脂牛奶作为封闭液进行封闭和一抗稀释液进行稀释。待目的蛋白和抗体充分结合后,用 TBST 洗脱液洗脱掉多余未结合的一抗,加入带有 HRP 标记的对应二抗,这样,我们的蛋白+一抗+二抗形成一个复合物,加以化学发光液,有靶蛋白的位置就会产生荧光,利用胶片或者化学发光仪就可以显现靶蛋白的条带显现。
WB常规实验流程:蛋白提取→蛋白定量→制胶→电泳→转膜→封闭→一抗孵育→一抗洗脱→二抗孵育→二抗洗脱→化学发光→数据分析。
二、WB实验试剂配置
在实验开始之前,可以按以下配方比例配置实验所需试剂。
1.电泳缓冲液
取 电泳缓冲液干粉(G2018-1L),溶解于 1L 纯水(G4701-500ML)中,置于磁力搅拌器(MS-150)上搅拌充分溶解。
2. 转膜缓冲液
取 转膜缓冲液干粉(G2017-1L),溶解于 800mL 纯水中,加入 200mL 的甲醇,置于磁力搅拌器上搅拌充分溶解。
3. TBST 缓冲液
取 TBS 粉剂(G0001-2L),溶解于 2L 纯水中,加入 1mL 吐温20,置于磁力搅拌器上搅拌充分溶解。
4. 5%脱脂牛奶
称量 5g 脱脂奶粉(G5002-100G),溶解于 100mL TBST 溶液(G0004-500ML)中,置于磁力搅拌器上搅拌至少 30分钟,然后放入 4℃冰箱暂放。
5.完全裂解液
1mL RIPA 裂解液(G2002-100ML或G2033-100ML)+20μL cocktail(G2006-250UL)+10μL磷酸化蛋白酶抑制剂 A(G2007-1ML)+10μL 磷酸化蛋白酶抑制剂 B(G2007-1ML)+10μL PMSF(G2008-1ML),除 RIPA 外,其他四种试剂使用前几分钟加入,现配现用。
三、WB实验步骤
由于文章篇幅限制,小赛这次先介绍组织或细胞的蛋白提取和蛋白定量常规流程。
蛋白提取
1 .组织总蛋白提取
准备好所需要数量的样本管;放入研磨珠,置于冰盒上备用;
组织块先用预冷 PBS洗涤 2-3 次,除去血污,然后放在滤纸上,吸尽多余的 PBS 后放入对应的匀浆管中,加入大约 10 倍样本体积的完全裂解液,置于组织研磨仪中,对称放置,确认放置平衡后,盖好盖子,选择程序开始匀浆。
Tips
① 芝麻大小的组织,一般加入100-200μL 完全裂解液;绿豆大小组织加入 400-600μL 完全裂解液;黄豆大小组织加入 800-1000μL完全裂解液。
② Servicebio三维研磨仪参考参数:2mm 氧化锆珠 8-12颗,频率6.5m/s,时间30s。如果一次匀浆不彻底,可以再次匀浆)。如果组织块比较大,可提前用剪刀将组织块剪碎。
2 悬浮细胞提取蛋白
将细胞连带培养基一起吸入 15mL 离心管(EP-1501-J)中,4℃,2000rpm,离心 5分钟,去掉上清;
加入 1mL PBS 溶液(G4202-500ML)重悬细胞,将细胞转移到 1.5mL 离心管(EP-150-M)中,然后 4℃,2000rpm,离心 5分钟,去掉上清,保留沉淀,重复此步骤 2-3 次(此步骤目的为清洗细胞中残留的培养基);
根据细胞沉淀的量加入适量的完全裂解液,例如沉淀体积为绿豆大小(大概 10uL 左右)的加入大约 200μL 完全裂解液,加入适量研磨珠,放入研磨仪进行裂解;
裂解完成后,12000rpm,4℃,离心 10分钟,上清即为总蛋白溶液。
3 贴壁细胞提取蛋白
倒掉培养基,沿细胞培养皿侧壁或者培养瓶瓶口慢慢加入 PBS 溶液,轻轻晃动平皿或者培养瓶,然后将细胞培养皿/瓶倾斜放置,用移液枪轻轻吸除残余液体,尽量轻柔,不要将细胞冲掉,清洗 2-3 次,最后一次将残余 PBS 完全吸干;
加入适当体积的完全裂解液(例如六孔板各单孔细胞长满的话,加入大约 250μL完全裂解液),反复晃动细胞培养皿/瓶,让裂解液与细胞完全接触,用细胞刮刀将细胞刮下来,收集后,加入研磨珠,放入研磨仪中进行裂解;
裂解完成后,12000rpm,4℃,离心 10分钟,上清即为总蛋白溶液。
蛋白定量
取适量上述步骤中未变性的总蛋白溶液,用 BCA 蛋白定量检测试剂盒(G2026-200T;G2026-1000T)测蛋白浓度,蛋白浓度测定方法如下:
A.配制蛋白标准贮备液
取1 mL蛋白标准配制液加入到蛋白标准品(BSA)蛋白标准管中,将25 mg蛋白标准品完全溶解,即得到浓度为25 mg/mL的蛋白标准贮备液。配制成的蛋白标准溶液可-20℃长期保存。
B.配制蛋白标准工作液
取适量25 mg/mL蛋白标准贮备液,用PBS或生理盐水稀释50倍,得到终浓度为0.5 mg/mL的蛋白标准工作液。注意稀释时按照10倍梯度方法稀释,确保稀释准确。
C.绘制标准曲线(酶标仪法)
将蛋白标准工作液分别按0、1、2、4、8、12、16、20 μL加到96孔板中,然后用PBS或生理盐水依次加20、19、18、16、12、8、4、0 μL将上述梯度工作液补足到20 μL。得到蛋白浓度依次为0、25、50、100、200、300、400、500 μg/mL的梯度曲线。
D.准备待测样品
将待测的蛋白样品进行适当稀释(可通过预实验检测,使样品蛋白浓度在标准曲线范围内,确保检测结果可信),按照每个样品20 μL的量加到96孔板中。待测样品与蛋白标准品用相同溶液稀释。
E.配制BCA显色工作液
将BCA试剂与硫酸铜溶液按照50:1体积比充分混合均匀,得到BCA显色工作液。BCA显色工作液可室温保存,24 h内使用。每个待测样品需200 μL,建议按需配制,避免浪费。
F.检测
向标准曲线样品孔及待测样品孔中每孔加入BCA显色工作液200 μL,充分混匀(可将96孔板放在振荡器上振荡30 s),37℃反应30 min后,以标准曲线0号做参比,在562 nm波长下比色测定,记录各孔吸光度值。(注:也可以在室温反应2 h,或60℃反应30 min。如果蛋白浓度较低,建议置于60℃反应)
G.计算
以标准曲线中梯度蛋白含量(μg/mL)为横坐标,吸光值为纵坐标,绘出标准曲线。根据所测样品的吸光值,在标准曲线上即可查得相应孔中待测样品的蛋白浓度(μg/mL),再乘以样品稀释倍数即为待测样品实际蛋白浓度。
Tips
1. BCA法测定蛋白浓度受温度和时间的影响较大,吸光度值会随着时间的延长或温度升高而变化,如果不能精确控制显色反应的时间和温度,建议每次测定都需要做标准曲线。
2. 在进行蛋白标准贮备液的配制时,需确保溶解充分。稀释配制蛋白标准工作液时建议10倍梯度稀释,不要一次稀释50倍,以免产生较大误差。
3. 为保证蛋白的精确定量,样品的提取和蛋白标准品的稀释配制最好选用相同的缓冲液,同保证两者检测条件一致。如果缓冲液本身就有较高的背景值,建议使用其他的方法测定。
4. 操作时请穿实验服,并佩戴一次性手套。
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