一、实验材料
1,RNA待测样本(注:本人用的是直接提取的RNA,为了实验更严谨,应当先进行mRNA纯化)
2,无酶水
3,TBST(1×TBS, 0.1%Tween-20)
4,封闭液
5,一抗
6,二抗
7,ECL显影液
8,亚甲蓝染色缓冲液(0.4M醋酸钠、0.4M醋酸中的0.2%亚甲蓝)
二,实验设备
无酶EP管
加热设备
NC膜 或 带正电荷的尼龙膜(建议使用尼龙膜,专门用来做核酸交联,效果比NC膜好)
干净的塑料盒或者培养皿
烘箱或者带有254nm灯泡的交联设备(可用紫外线消毒灯代替,1m范围内有效)
显影设备
三,流程
1,取出待测RNA样本,解冻后测量RNA浓度,全程冰上操作。
2,将样品浓度统一,并在新的无酶管连续稀释样品并混匀,稀释梯度不固定,可自己试试最好效果。我选择的终浓度为400/200/100 ng/μL 。
3,离心后,将RNA样品95℃加热3分钟以破坏二级结构,结束后立即冰上冷却,防止重新形成二级结构。
4,用1ml枪头粗端在NC膜上留下圆形印记,以引导加样,随后将NC膜裁剪成合适的尺寸,转移至干净的塑料盒中。
5,将2μl RNA样品按顺序滴在NC膜上,注意枪头不要碰膜,样品应在膜上自然扩散,每次加样都需要更换枪头。
6,室温下NC膜上稍干燥后可进行RNA与膜的交联。方法一:37℃烘箱 30min。方法二:254nm波长的紫外线灯下照射30min-1h。
7,10ml TBST清洗膜5min,洗去未结合的RNA。
8,弃去TBST,加入10ml封闭液,室温摇动孵育1小时。
9,弃去封闭液,加入含有一抗的封闭液4℃孵育过夜。
10,10ml TBST清洗膜3次,每次10min。
11,二抗室温孵育1小时。
12,同第10步。
13,ECL底物孵育5min
14,显影仪下拍照
15,拍完照后,将膜放置于10ml亚甲蓝染色缓冲液中,室温摇动孵育30min
16,用ddH2O清洗至背景大致干净即可,约30-60s
17,白光成像采集亚甲蓝染色后的图像作为负载对照。
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